为了更好地完成数学试卷、教案、论文等的编写工作，从《数学工具》5.5.5版开始，《数学工具》增加了配置功能。它能使我们的文档模板更有利于编写和数学有关的文档。
2）、公式配置：
“公式配置”主要是针对用《数学工具》的快捷键“Ctrl+Alt+?”生成公式时是否需要美化而作的一个配置，界面如下图：
 
《数学工具》默认是每次生成公式后都要美化公式。
“美化公式”是指每次生成公式后对公式的字体进行设置的过程。如果选择不美化公式，则每次只生成公式，不对其字体进入设置，而选择了美化公式，则对其中的英文小写字母的字体设置为：字体名——Times New Roman；字体：斜体。这样的设置会使公式看上去更观。
下面两组公式可以直观地看到公式美化的效果：
美化前：       美化后： 
美化前：    美化后：
须注意的是选择了美化公式，则在生成公式后《数学工具》会将公式切换到域代码状态，然后逐个检查是否为小写英文字母，然后再进行相关字体设置，所以您会看到如下图的状态： 
 ，整个公式的代码处于选中状态（黑色高亮），并且还会出现闪烁和长度的变化，曾经有网友说是《数学工具》不稳定，其实是《数学工具》在进行公式的美化过程。所以，选择美化公式也会使公式生成的时间比不美化所用的时间要长，您可以根据您的具体情况决定是否需要美化公式。